微生物学における滅菌（または滅菌）は、表面に存在する伝染性物質（真菌、細菌、ウイルス、胞子の形態など）を含む、あらゆる形態の微生物を排除（除去）または殺すプロセスを指す用語です。液体、薬剤、または生物培養培地などの化合物に含まれています。滅菌は、熱、化学薬品、照射、高圧、およびろ過を適切に組み合わせることによって達成できます。

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一般に、体のすでに無菌の部分 (血流や皮膚を貫通するものなど) に入る手術器具や医薬品は、高い無菌保証レベル (SAL) まで滅菌する必要があります。このような器具の例としては、メス、皮下注射針、人工ペースメーカーなどがあります。これは非経口医薬品の製造にも不可欠です。

定義としての滅菌は、すべての生命を終わらせます。一方、消毒と消毒は選択的かつ部分的に終了します。衛生化と消毒の両方で、対象となる病原体の数を「許容できる」レベルと見なされるレベルまで減らします。このクラスのプロセスの例は低温殺菌です。

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滅菌方法には次のものがあります。
・加熱殺菌
- 化学滅菌
- 放射線滅菌
- 無菌ろ過