עיקור (או עיקור) במיקרוביולוגיה הוא מונח המתייחס לכל תהליך שמבטל (מסיר) או הורג את כל צורות החיים המיקרוביאליות, כולל חומרים הניתנים להעברה (כגון פטריות, חיידקים, וירוסים, צורות נבגים וכו') המצויים על משטח, הכלולים בנוזל, בתרופות או בתרכובת כמו מדיית תרבות ביולוגית. עיקור יכול להיות מושגת על ידי יישום השילובים הנכונים של חום, כימיקלים, הקרנה, לחץ גבוה וסינון.

​

באופן כללי, מכשירים כירורגיים ותרופות הנכנסים לחלק כבר אספטי בגוף (כגון מחזור הדם או חודרים לעור) חייבים לעבור עיקור לרמת אבטחת סטריליות גבוהה, או SAL. דוגמאות למכשירים כאלה כוללים אזמלים, מחטים היפודרמיות וקוצבי לב מלאכותיים. זה חיוני גם בייצור של תרופות פרנטרליות.

עיקור כהגדרה מסיים את כל החיים; ואילו חיטוי וחיטוי מסתיימים באופן סלקטיבי וחלקי. גם חיטוי וגם חיטוי מפחיתים את מספר האורגניזמים הפתוגניים הממוקדים למה שנחשבים לרמות "מקובלות" - רמות שגוף בריא למדי, שלם, יכול להתמודד איתן. דוגמה לסוג זה של תהליך הוא פסטור.

​

בין שיטות העיקור יש לנו:
- עיקור בחום
- עיקור כימי
- עיקור קרינה
- סינון סטרילי